Doit son nom à la Johannisthaler Chaussee, l’ancienne route de Johannisthal.
La route est l’ancienne liaison entre le village de Buckow et la Königsheide, à Johannisthal ; elle portait ce nom avant 1911. Johannisthal lui-même doit son nom à son fondateur, Johann Wilhelm Werner (mort en 1754). La station, ouverte en 1970, porte en plus le nom de Gropiusstadt, le quartier qui l’entoure.