Baychester associe l'Eastchester Bay voisine au « chester » de noms de lieux plus anciens.
Selon Forgotten New York, Baychester fut un lotissement des années 1890 dont le nom combinait les « chester » d'Eastchester et de Westchester avec l'Eastchester Bay toute proche. Lehman College situe le quartier entre les établissements coloniaux de Westchester et d'Eastchester. « Chester » vient du latin castrum, qui signifie camp militaire ou fort.