Nommée d'après le boulevard Malesherbes, qui honore Chrétien Guillaume de Lamoignon de Malesherbes (1721-1794).
Le premier tronçon, depuis la Madeleine, reçut ce nom par une ordonnance du 2 juin 1824 ; la nomenclature de la Ville rattache ce choix au voisinage de la chapelle expiatoire, dédiée à la mémoire de Louis XVI. Magistrat, botaniste et homme d'État, Malesherbes dirigea la censure royale et s'en servit pour soutenir l'Encyclopédie de Diderot et d'Alembert. Défenseur de Louis XVI à son procès, il fut guillotiné sous la Terreur.