Nommée d'après la place Saint-Michel, à l'extrémité nord du boulevard du même nom.
La place doit son nom au pont Saint-Michel, qui le reçut en 1424 de la chapelle Saint-Michel toute proche, dans le palais royal. Elle fut percée en 1855 avec le boulevard et reçut officiellement son nom en 1864. La station passe en courbe sous la place, de la rue Danton à la Seine, sous une voûte particulièrement haute de 12,5 mètres.