Benannt nach dem MuseumsQuartier im Gebäude der ehemaligen kaiserlichen Hofstallungen.
Kaiser Karl VI. ließ gegenüber der Hofburg Hofstallungen errichten; der Bau von Johann Bernhard Fischer von Erlach wurde 1723 von seinem Sohn Joseph Emanuel vollendet und bot Platz für 600 Pferde. Ab 1921 diente er als Messegelände, der Messepalast, und wurde 2001 als MuseumsQuartier eröffnet. Die Station hieß zuerst Mariahilfer Straße, dann Babenbergerstraße.