Benannt nach Pankow und Heinersdorf, den beiden Ortsteilen, die hier aneinandergrenzen.
Der Haltepunkt liegt im Osten Pankows; jenseits des angrenzenden früheren Rangierbahnhofs beginnt Heinersdorf, ein um 1230 gegründetes Dorf, das 1319 als „Hinrickestorppe“ erstmals erwähnt wurde, als Markgraf Woldemar es an das Berliner Heilig-Geist-Hospital verkaufte. Der Bahnhof wurde 1893 eröffnet und 1924 als einer der ersten in Berlin von elektrischen Zügen angefahren.