« Homerton » rappelle la ferme d'une femme nommée Hūnburh.
Le nom est attesté pour la première fois en 1343, souvent sous la forme Humberton. En 1363, c'était un hameau au nord du Hackney Brook, aujourd'hui enfoui, le long d'une route partant vers l'est depuis le village de Hackney ; en 1551, cette route s'appelait Humberton Street, et depuis 1935 Homerton High Street. Les vestiges d'un bâtiment du XIe ou XIIe siècle découverts à Link Street laissent penser que le lieu est plus ancien que sa première mention.