Benannt nach der West 103rd Street, im einst Clendening Valley genannten Viertel.
Die 103rd Street ist eine der gewöhnlichen, 60 Fuß breiten Querstraßen des Rasters von 1811. Anfang des 19. Jahrhunderts besaß John Clendening eine Farm, die einen Großteil dieses Tals bedeckte, etwa zwischen 99th und 105th Street; die Gegend hieß Clendening Valley. Das Anwesen wurde 1845 verkauft, doch der Name hielt sich bis in die 1880er-Jahre. Der heutige Name Manhattan Valley setzte sich in den 1980er-Jahren durch.