Nommée d'après la 168th Street ; la station s'appelait autrefois Washington Heights–168th Street.
Washington Heights doit son nom à Fort Washington, construit en 1776 sur le point naturel le plus élevé de Manhattan, pendant la défense de New York menée par George Washington. Le 16 novembre 1776, des troupes britanniques et hessoises attaquèrent et prirent le fort, faisant 2 838 prisonniers américains. Après la guerre, les traces du fort disparurent et les environs prirent le nom de Washington Heights.