Jackson Heights ist nach der Jackson Avenue benannt, die ihrerseits nach John C. Jackson benannt war.
Bis 1909 war die Gegend ein Sumpf namens Trains Meadow. In jenem Jahr kaufte Edward A. MacDougalls Queensboro Corporation das Land und benannte es nach der Jackson Avenue, dem heutigen Northern Boulevard; „Heights“ sollte an das Prestige von Brooklyn Heights anklingen. Die Roosevelt Avenue, 1917 aus mehreren Straßen zusammengefügt, ehrt Präsident Theodore Roosevelt; manche Quellen nennen auch Franklin D. Roosevelt.