Nommée d’après les New York Mets et Willets Point, un nom venu de la famille Willets.
« Mets » fut adopté comme abréviation du nom officiel du club, en rappel des Metropolitans, une équipe new-yorkaise de 1880 à 1887. Willets Point tient son nom de Willets Point Boulevard ; le Willets Point d’origine est le cap de Fort Totten près de Bayside, terrain que l’État acheta à la famille Willets en 1857. La station ouvrit en 1927 sous le nom de Willets Point Boulevard.