Nommée d'après la West 8th Street et le New York Aquarium de Coney Island.
L'aquarium fut fondé en 1896 à Castle Garden, dans Battery Park, à Manhattan. La ville le ferma à cet endroit fin 1941, après que Robert Moses eut annoncé la démolition de Castle Garden pendant les travaux du Brooklyn–Battery Tunnel, et il rouvrit à Coney Island le 6 juin 1957. La station s'appelait d'abord Coney Island–West Eighth Street.