Nommée d'après la rue Pernety, qui honore le général Joseph Marie de Pernety (1766-1856).
Général d'artillerie présent à Austerlitz et à Iéna, il possédait les terrains sur lesquels la rue fut ouverte. Avant 1860, la rue formait trois voies sur les communes de Montrouge et de Vaugirard ; en 1868, le tronçon de la rue Pernety donna son nom aux autres. Le nom est sans rapport avec Maurice Pernety, chef de cabinet du préfet Haussmann à l'époque.