Nommée d'après la porte de Pantin, qui s'ouvrait sur la commune de Pantin.
La porte se trouvait sur l'ancienne route d'Allemagne, l'actuelle avenue Jean-Jaurès. Depuis 1987, la station a pour sous-titre Parc de la Villette, d'après le parc aménagé sur le site des anciens abattoirs. Elle a ouvert en 1942.