Nommée d’après le Margaretengürtel, le tronçon du boulevard périphérique nommé d’après Margareten.
Ce tronçon du Gürtel (le boulevard périphérique) fut baptisé en 1881 d’après le faubourg de Margareten. Margareten doit son nom à une chapelle dédiée à sainte Marguerite d’Antioche, fondée en 1388–1395 dans le manoir local – et non, comme l’affirment d’anciens ouvrages, à Marguerite Maultasch. La station s’écrivait d’abord « Margarethengürtel » ; le « h » disparut après la conférence orthographique de 1901.