Doit son nom à l’université de Berlin, l’actuelle Humboldt-Universität.
La rue fut nommée en 1815 d’après l’université fondée en 1809 par le roi Frédéric-Guillaume III et ouverte aux étudiants en 1810 ; elle s’appelle Humboldt-Universität depuis 1949. Auparavant, la ruelle était la Stallgasse (ruelle des écuries). Elle relie la Georgenstraße à Unter den Linden, où se trouve le bâtiment principal de l’université.