Nommée d’après la 82nd Street et Jackson Heights, qui rappelle l’entrepreneur John C. Jackson.
En 1909, la Queensboro Corporation d’Edward A. MacDougall acheta des terres dans un marais appelé Trains Meadow et les nomma d’après Jackson Avenue, elle-même nommée d’après John C. Jackson, entrepreneur respecté du Queens. « Heights » faisait écho au prestige de Brooklyn Heights. La station ouvrit en 1917 sous le nom de 25th Street et porte son nom actuel depuis 1925.