Nommée d’après Atlantic Avenue et la salle Barclays Center voisine.
En 2009, la banque Barclays, qui détenait aussi les droits de nommage de la salle, acheta le nom de la station pour 20 ans, à 200 000 dollars par an ; elle devint Atlantic Avenue–Barclays Center en mai 2012. Atlantic Avenue fut au XVIIIe siècle un chemin menant à la ferme de Ralph Patchen, au bord de l’East River. En 1816, c’était District Street, en 1855 Atlantic Street, et vers 1870 Atlantic Avenue.