Der Name verweist auf das Gerichtsgebäude von Long Island City, 25-10 Court Square.
Das Gericht, entworfen von George Hathorne, wurde in den 1870er-Jahren gebaut, nachdem das Staatsparlament 1870 die Verlegung des Sitzes des Queens County nach Long Island City genehmigt hatte; nach einem Brand 1904 wurde es umgebaut und erweitert. Die beiden Stationen hießen einst 45th Road–Court House Square und Long Island City–Court Square; 2011 wurden beide schlicht in Court Square umbenannt.