Nommée d'après la commune de Saint-Ouen-sur-Seine et sa gare RER.
La station se trouve à la limite entre Saint-Ouen et Clichy et devait s'appeler Clichy – Saint-Ouen. Une règle d'Île-de-France Mobilités impose un nom unique aux stations en correspondance : elle a donc pris le nom de la gare existante du RER C, au regret de Clichy. Elle a ouvert en 2020.