Benannt nach Nikolassee, der Villenkolonie, die den Namen eines kleinen Sees übernahm.
Die Villenkolonie wurde 1901 gegründet und übernahm den Namen des Nikolassees; der Bahnhof wurde 1902 eröffnet. Seinen Namen erhielt der See von den Zisterziensermönchen des Klosters Lehnin, die ihn mit allerhöchster Wahrscheinlichkeit 1242 erwarben und zu Ehren des heiligen Nikolaus (mittelniederdeutsch „Klawes“) „St. Clawes See“ nannten. 1652 taucht die Bezeichnung „Niclas See“ auf.