« Wapping » pourrait venir de wapol, un marais.
On a longtemps pensé que le nom désignait l'établissement du peuple de Waeppa, mais des travaux plus récents en doutent : la zone était presque entièrement marécageuse, peu propice à un habitat ancien, et aucun nom de personne de ce genre n'a été trouvé. Le moulin de Wapping est mentionné en 1218. La gare a ouvert en 1869 sous le nom de Wapping and Shadwell et s'appelle simplement Wapping depuis 1876.