Benannt nach der 81st Street und dem American Museum of Natural History daneben.
Der Naturforscher Albert S. Bickmore hatte 1861 die Idee zu dem Museum; das Gesetz zu seiner Gründung wurde am 6. April 1869 unterzeichnet. Es füllt größtenteils das Gelände des einstigen Manhattan Square. Pläne von 1928 sahen eine Station an der 79th Street vor, dem Haupteingang des Museums; mit Rücksicht auf das Museum liegt die Station an der 81st statt an der 79th Street, hat aber einen eigenen Zugang ins Museum.