Benannt nach der South Ferry, einer Fährverbindung nach Brooklyn, die südlicher verlief als die älteren.
Der Name bezieht sich nicht auf die Südspitze Manhattans. Die South Ferry Company eröffnete die South Ferry am 16. Mai 1836 zwischen Lower Manhattan und dem Ende der Atlantic Avenue in Brooklyn, auf einer südlicheren Route als die älteren Fähren Fulton Ferry und Catherine Ferry. Das Vorhaben hieß seit 1826 „New South Ferry“.