Nommée d'après le South Ferry, un bac vers Brooklyn qui passait plus au sud que les anciens.
Le nom ne vient pas de la pointe sud de Manhattan. La South Ferry Company ouvrit le South Ferry le 16 mai 1836 entre Lower Manhattan et le bas d'Atlantic Avenue à Brooklyn, sur une route plus au sud que celles des anciens bacs Fulton Ferry et Catherine Ferry. Le projet s'appelait « New South Ferry » depuis 1826.