Nommée d'après la place et la rue Jussieu, qui honorent le botaniste Antoine-Laurent de Jussieu (1748-1836).
Il enseigna la botanique au Muséum national d'histoire naturelle. La station s'appelait autrefois Jussieu - Halle aux Vins, d'après la halle aux vins créée par Napoléon, à l'emplacement de l'actuel campus universitaire.