Du nom du château de Schönbrunn, ancienne résidence d’été des Habsbourg.
Le château doit son nom au Schöner Brunnen, la « belle source » de son parc. Selon une histoire aujourd’hui tenue pour une légende, l’empereur Matthias aurait découvert la source au cours d’une chasse. Le nom Schönbrunn apparaît pour la première fois sur une facture du 24 janvier 1642. Malgré son nom, la station se trouve en majeure partie sur la commune cadastrale de Rudolfsheim ; la limite traverse le bâtiment de la station.